Pingwiny z Madagaskaru wracają do Central Parku, gdzie muszą zmierzyć się z nowymi wyzwaniami i nieoczekiwanymi gośćmi. Po przygodach w filmie, cztery znane pingwiny – Skiper, Kowalski, Rico i Szeregowy – mają zamiar przejąć kontrolę nad zoo.
W tej kontynuacji przygód pingwinów, ich lider Skiper oraz strateg Kowalski planują kolejne akcje. Rico, specjalista od zadań specjalnych, i Szeregowy, który pełni funkcję pomocnika, muszą stawić czoła nowym przeciwnikom. W międzyczasie Król Julian i jego banda lemurów dołączają do zespołu.
To nie tylko powrót do Central Parku; pingwiny napotykają również na nowe zagrożenia. Oficer X powraca jako Dezynsektator X, co zapowiada nowe wyzwania dla zespołu. Szeregowy musi pokonać swój strach przed robakami — to zadanie będzie dla niego szczególnie trudne.
Dodatkowo, koala Leonard terroryzuje mieszkańców parku, atakując ich nocą. To sprawia, że sytuacja staje się coraz bardziej napięta. Czy pingwiny będą w stanie poradzić sobie z tymi problemami?
Ponadto Szeregowy dostaje pod opiekę cztery urocze kaczątka, co dodaje mu dodatkowej odpowiedzialności. Drużyna pingwinów rusza również w szalony wyścig monster trucków — to może być ich największe wyzwanie!
Grupa pingwinów wraca do Central Parku po wydarzeniach z filmu 'Madagaskar’, a Lew Alex, hipopotamica Gloria, żyrafa Melman i zebra Marty pozostają w Afryce. Jakie przygody czekają na nich tym razem?
